Реконструкция сигналов мозга грызунов во время эвтаназии с использованием алгоритма Eigensystem Realization Algorithm (ERA)

Реконструкция сигналов мозга грызунов во время эвтаназии с использованием алгоритма Eigensystem Realization Algorithm (ERA)

Интересное сегодня

Тренировка штрафных бросков в баскетболе с дополненной реаль...

Введение в методику тренировки штрафных бросков Бросковая техника является важнейшим навыком в баске...

Аутизм и расстройства пищевого поведения: связь между ARFID ...

ВведениеРасстройство аутистического спектра (РАС) — это нейроразвивающееся расстройство, характеризу...

Изменения в восприятии изображений лиц у людей с аутизмом

Параидолия и аутизм Параидолия - это феномен восприятия несуществующих лиц в незначительных элемента...

Как найти свое призвание и создать изменения

ВведениеКогда вы пытаетесь внедрить новую привычку с силой воли, и затем чувствуете себя неудачником...

Эффективность в избыточности: как дублирование когнитивных с...

Введение Многие естественные и созданные человеком системы характеризуются наличием избыточности. В ...

Что такое брекетинг в качественных исследованиях: методы и п...

Что такое брекетинг в качественных исследованиях? Брекетинг (также известный как эпохэ или феноменол...

Рисунок 2
Рисунок 2
Рисунок 3
Рисунок 3
Рисунок 4
Рисунок 4
Рисунок 5
Рисунок 5
Рисунок 6
Рисунок 6
Рисунок 7
Рисунок 7
Рисунок 1
Рисунок 1
Thumbnail 1
Thumbnail 2
Thumbnail 3
Thumbnail 4
Thumbnail 5
Thumbnail 6
Thumbnail 7
Thumbnail 8
Thumbnail 9
Thumbnail 10
Оригинал исследования на сайте автора

Введение

Понимание сложных биологических и физических процессов долгое время основывалось на нелинейных системах и теории управления. В последние годы методы, основанные на данных, стали мощной альтернативой традиционным подходам, предлагая более простые математические уравнения для описания наблюдаемых данных. Эти методы позволяют реконструировать сложные сигналы с использованием больших линейных систем. В данном исследовании мы применяем такие методы для анализа сигналов локальных полевых потенциалов (LFP), записанных из мозга анестезированных и свободно передвигающихся крыс до и во время эвтаназии CO2.

Методы

Животные и экспериментальные процедуры

Экспериментальные данные были получены из предыдущего исследования мигрени у грызунов. Использовались десять самцов крыс Sprague Dawley, разделенных на две группы: бодрствующих (AW) и анестезированных (AN). Анестезия поддерживалась изофлураном.

Расположение имплантированных электродов LFP

На основе атласа мозга Paxinos и Watson четыре биполярных электрода были имплантированы в следующие области: передняя поясная кора (ACC), заднее ядро таламуса (Po), тройничный ганглий (TG) и первичная зрительная кора (V1M).

Администрирование CO2 и клиническая смерть

Эвтаназия начиналась после 5 минут записи базовых LFP, при этом непрерывно подавался 100% CO2. Клиническая смерть подтверждалась через 5–7 минут.

Предварительная обработка данных

Длинные записи были разделены на фазы по 5 минут. Для уменьшения шума применялась функция сглаживания в MATLAB. Алгоритм BEAST использовался для сегментации временных рядов.

Алгоритм Eigensystem Realization Algorithm (ERA)

ERA применялся для идентификации линейной динамической системы, способной генерировать наблюдаемые данные. Метод основан на сингулярном разложении матрицы Ганкеля, построенной из временных рядов.

Результаты

Точные реконструкции LFP с использованием ERA

ERA обеспечил высококачественные реконструкции временных рядов для всех каналов. Количество стеков (NS) варьировалось в зависимости от фазы эксперимента и состояния крысы.

Изменение NS в различных фазах

После введения CO2 значения NS снижались, отражая уменьшение функциональности мозга. У бодрствующих крыс наблюдался более устойчивый профиль сложности.

Биологическая валидация снижения NS

Снижение NS коррелировало с уменьшением активности мозга, что подтверждалось анализом спектра мощности. У бодрствующих крыс отмечался феномен «последнего сопротивления».

Обсуждение

Представленный вычислительный framework позволяет точно реконструировать LFP-сигналы и анализировать изменения в сложности мозга во время эвтаназии. Методология может быть применена к другим типам электрофизиологических данных.

Методологические ограничения

Основные ограничения включают невозможность учета внешних стимулов в текущей формулировке ERA. В будущих исследованиях планируется ввести параметр для временных внешних воздействий.

Биологические инсайты и будущие исследования

Планируется применение модели к публичным наборам данных, таким как записи Allen, для дальнейшей валидации. Также необходимо изучить механизмы «последнего сопротивления».

Короткие версии статей можно найти в телеграм-канале.

Посмотреть канал
Кликните еще раз для перехода

Крем-бальзам Акулий жир с муравьиной кислотой и сабельником

Крем-бальзам Акулий жир с муравьиной кислотой и сабельником помогает при болях в суставах и позвоноч...

Витаминные пастилки Натурино Черная Смородина №8

Натурино Пастилки Витаминные Черная Смородина №8 – вкусная БАД с натуральным соком для восполнения д...

Крем для ног Лекарь с мочевиной от натоптышей и мозолей

Крем Лекарь с мочевиной эффективно смягчает натоптыши, сухие мозоли и огрубевшую кожу стоп. Помогает...

Жир печени трески Солгар: витамины А, D и омега-3

Солгар Жир из печени норвежской трески в капсулах — дополнительный источник витаминов А, D и омега-3...

Биодерма Атодерм Гель для душа 200 мл | Аптека

Биодерма Атодерм Гель для душа 200 мл — мягкое очищение лица и тела с сохранением гидролипидного бал...

Витамин С и Шиповник Солгар 500 мг - купить в аптеке

Таблетки Солгар Витамин С и Шиповник 500 мг — дополнительный источник витамина С с антиоксидантным д...